NATURA 2000 – sústava chránených území členských krajín Európskej únie. Jej cieľom je zachovanie najvzácnejších a najohrozenejších biotopov a druhov na území štátov EÚ. Sústavu chránených území NATURA 2000 v CHKO Ponitrie reprezentuje vzhľadom na bohatý výskyt biotopov a druhov európskeho významu 7 území európskeho významu (schválené rozhodnutiami európskej komisie na prelome rokov 2007 a 2008 s doplnením a rozšírením existujúcich území v roku 2011) a v centrálnej časti CHKO chránené vtáčie územie (vyhlásené v roku 2008). Viac informácií o NATURA 2000 a o chránených územiach môžete nájsť aj na www.sopsr.sk/natura/.
Územia európskeho významu
ÚEV Zobor – identifikačný kód: SKUEV0130, výmera: 1904,79 ha
Územie pokrýva takmer celé Zoborské vrchy – najjužnejší výbežok pohoria Tribeč. Pestrá geologická stavba spolu s orientáciou svahov podmienila vznik rôznorodých biotopov európskeho a národného významu spolu s výskytom viacerých chránených druhov rastlín a živočíchov. Komplex tu tvoria vresoviská a krovinové biotopy (4030, 40A0*), prirodzené a poloprirodzené travinno-bylinné biotopy (6110*, 6190, 6210, 6240*, 6510), skalné biotopy a jaskyne (8150, 8160*, 8210, 8220, 8310) a dominantné lesné biotopy (9130, 9150, 9180*, 91E0*, 91G0*, 91H0*, 91I0*, 91M0).
Z druhov európskeho významu sa tu vyskytujú: jazýčkovec východný (Himantoglossum caprinum), peniažtek slovenský (Thlaspi jankae), poniklec veľkokvetý (Pulsatilla grandis), koník slovanský (Stenobothrus eurasius), roháč obyčajný (Lucanus cervus), fuzáč alpský* (Rosalia alpina), fuzáč veľký (Cerambyx cerdo), spriadač kostihojový* (Callimorpha quadripunctata), kunka červenobruchá (Bombina bombina), netopier obyčajný (Myotis myotis), podkovár malý (Rhinolophus hipposideros) a uchaňa čierna (Barbastella barbastellus).
ÚEV Gýmeš – identifikačný kód: SKUEV0131, výmera: 73,41 ha
Územie sa nachádza v okolí zrúcanín hradu Gýmeš v blízkosti obce Jelenec. Pomerne malé územie je zaujímavé bohatým výskytom viacerých biotopov európskeho významu: krovinové biotopy (4030), prirodzené a poloprirodzené travinno-bylinné biotopy (6110*, 6210), skalné biotopy a jaskyne (8150, 8220), lesné biotopy (91I0*, 91G0*, 9180*, 91M0, 91H0*) a druhov európskeho významu: poniklec veľkokvetý (Pulsatilla grandis), fuzáč alpský* (Rosalia alpina), fuzáč veľký (Cerambyx cerdo), roháč obyčajný (Lucanus cervus), kunka červenobruchá (Bombina bombina), netopier obyčajný (Myotis myotis), podkovár malý (Rhinolophus hipposideros) a uchaňa čierna (Barbastella barbastellus).
ÚEV Hôrky – identifikačný kód: SKUEV0133, výmera: 82,42 ha
Územie zahŕňa tri samostatné lokality na severozápadnom okraji Tribeča. Spoločným znakom území je prítomnosť skalných útvarov – kremencových hôrok s výskytom kyslých podzolových pôd, na ktorých sa vyvinuli aj typické typy biotopov európskeho významu: vresoviská a krovinné biotopy mierneho pásma (4030), skalné biotopy a jaskyne (8150, 8220), lesné biotopy (91I0*, 91G0*, 9180*) s druhmi európskeho významu: fuzáč alpský* (Rosalia alpina) a roháč obyčajný (Lucanus cervus).
ÚEV Sokolec – identifikačný kód: SKUEV0593, výmera: 224,76ha
V území doplnenom na ochranu v roku 2011 sa vyskytuje mozaika lúčnych a lesných spoločenstiev, ktoré reprezentujú prevažne kosné lúky (6510) a viaceré lesné biotopy (9110, 9130, 9150 a 9180*). Územie je aj biotopom nasledovných druhov netopierov: podkovár malý (Rhinolophus hipposideros), podkovár veľký (Rhinolophus ferrumequinum), uchaňa čierna (Barbastella barbastellus), netopier pobrežný (Myotis dasycneme), netopier veľkouchý (Myotis bechsteini) a netopier obyčajný (Myotis myotis).
ÚEV Stráž – identifikačný kód: SKUEV0013, výmera: 19,83 ha
Územie vo východnej časti pohoria Tribeč. Komplex lúčneho (6210) a lesného biotopu (9130) sa nachádza na kóte Stráž. Vyskytuje sa tu druh európskeho významu popolavec dlholistý moravský (Tephroseris longifolia subsp. moravica). V roku 2011 bolo schválené rozšírenie územia pod rovnomenným názvom (identifikačný kód SKUEV1013, výmera 329,04ha), ktoré ochranu územia dopĺňa o biotop kosných lúk (6510) a vápnomilných bučín (9150)
ÚEV Tomov štál – identifikačný kód: SKUEV0023, výmera: 1,53ha
Rozlohou menšie územie vo východnej časti Tribeča zahŕňa jelšový porast – lesný biotop európskeho významu (91E0*).
ÚEV Hôrky – identifikačný kód: SKUEV0133, výmera: 82,54ha
Územie zahŕňa tri samostatné lokality na severozápadnom okraji Tribeča. Spoločným znakom území je prítomnosť skalných útvarov – kremencových hôrok s výskytom kyslých podzolových pôd, na ktorých sa vyvinuli aj typické typy biotopov európskeho významu: vresoviská a krovinné biotopy mierneho pásma (4030), skalné biotopy a jaskyne (8150, 8220), lesné biotopy (91I0*, 91G0*, 9180*) s druhmi európskeho významu: fuzáč alpský* (Rosalia alpina) a roháč obyčajný (Lucanus cervus).
ÚEV Sokolec – identifikačný kód: SKUEV0593, výmera: 224,76ha
V území doplnenom na ochranu v roku 2011 sa vyskytuje mozaika lúčnych a lesných spoločenstiev, ktoré reprezentujú prevažne kosné lúky (6510) a viaceré lesné biotopy (9110, 9130, 9150 a 9180*). Existujúce skalné útvary slúžia aj pre zimovanie netopierov: podkovár malý (Rhinolophus hipposideros), podkovár veľký (Rhinolophus ferrumequinum), uchaňa čierna (Barbastella barbastellus), netopier pobrežný (Myotis dasycneme), netopier veľkouchý (Myotis bechsteini) a netopier obyčajný (Myotis myotis).
Chránené vtáčie územie
CHVÚ Tribeč (identifikačný kód SKCHVU031, výmera: 23 802,8ha)
Prevažná časť územia sa nachádza v dubových a bukových lesných porastoch Tribeča. Územie vo svojej severozápadnej časti pokrýva aj poľnohospodársku pôdu v okolí obcí, pričom hranica územia zasahuje po rieku Nitra. Lesné porasty Tribeča sú dlhodobým a tradičným miestom pre hniezdenie orla kráľovského (Aquila heliaca). V priemere tu ročne hniezdia 3 páry orlov. Územie je významné aj z dôvodu ochrany a výskytu ďalších vtáčích druhov: ďateľ prostredný (Dendrocopos medius), hrdlička poľná (Streptopelia turtur), krutohlav hnedý (Jynx torquilla), lelek obyčajný (Caprimulgus europaeus), muchár sivý (Muscicapa striata), muchárik bielokrký (Ficedula albicollis), penica jarabá (Sylvia nisoria), prepelica poľná (Coturnix coturnix), včelár lesný (Pernis apivorus), výr skalný (Bubo bubo) a žltochvost hôrny (Phoenicurus phoenicurus).